При продаже квартиры Вам придётся уплатить подоходный налог лишь в том случае, если Вы владеете продаваемой квартирой на праве собственности менее трёх лет.
При этом Вы можете воспользоваться имущественным налоговым вычетом и заплатить налог с суммы, полученного Вами дохода за вычетом 1 млн. рублей.
    _1 500 000 — сумма, за которую продана квартира
      1 000 000 — имущественный налоговый вычет
         500 000 — сумма, с которой должен уплачиваться налог 13%

Вместо использования права на получение имущественного налогового вычета Вы вправе уменьшить сумму облагаемого налогом дохода на сумму фактически произведённых и документально подтверждённых расходов, связанных с получением этого дохода.
    _1 500 000 — сумма, за которую продана квартира
      1 300 000 — сумма, за которую квартира была ранее куплена
         200 000 — сумма, с которой должен уплачиваться налог 13%
Вариант расчёта выбирать Вам.